El Departamento de Ingeniería Industrial y Sistemas fue creado en 1969, caracterizándose por entregar una sólida formación a sus estudiantes. Hoy en día ofrece el Major de Investigación Operativa y el Minor de Ingeniería Industrial, conducentes al título de Ingeniería Civil de Industrias para pregrado, mientras que en postgrado ofrece programas de Magíster y Doctorado en Ciencias, y de Magíster profesional. También desarrolla investigación de punta en las áreas de la Ingeniería Industrial y aporta a la sociedad mediante diversos proyectos de transferencia tecnológica.